多少有一定的影响，主要还是看浓度，一般投苗之后尽量不使用生石灰消毒或是青苔，现在市面有很多杀青苔的生物药剂，可以使用。
当地人处理青苔使用的方法是利用生石灰，20-60斤/亩不等，认为可以处理青苔，同时可以消毒杀菌、补钙、净化水质。但是真的如此吗？
经分析：
青苔的由来：
1.水清、水浅（水清水浅的塘口光照好）的池塘易长青苔。
2.池塘中氮肥多（水稻田种植水稻时使用大量的尿素、复合肥，有青苔的塘口，不会选肥，用下去之后适得其反）；缺碳少钙的池塘易长青苔。
3.螺丝过多导致水质清瘦易长青苔。
4.投放螺丝、栽种水草时带入青苔芽孢。
石灰是一种以氧化钙为主要成分的气硬性无机胶凝材料；是用石灰石、白云石、白垩、贝壳等碳酸钙含量高的产物，经900～1100℃煅烧而成。在水产上属于强碱类消毒杀菌制剂，具有较强的碱性、遇水产生大量热量，石灰从船上或者盆子里泼到虾田中，与水体继续反应产热，从而导致：
1.加速倒在坂田水里稻茬的腐烂，导致水质恶化、水质指标超标；
2.杀害有益菌、杀藻，破坏菌相藻相平衡；
3.烧草，叶子发黄、打卷、挂脏，严重时草根发黄、发黑腐烂；
4.伤虾，体外：应激大，烧蚀龙虾甲壳，同时氨氮高的塘口使用强碱类制剂会加重氨氮毒性，严重时出现伤亡；体内：渗透压失衡，部分组织结构水肿，吃料差；
5.用完生石灰后不能及时针对性解毒，烧死的青苔不及时捞掉，会沉到池底坏水坏底，加重水质恶化，为中后期养殖留下隐患；
6.继而导致龙虾前期数量得不到保证，后期收获时没产量，最终收益得不到保证。
杀青苔的方法分为放虾苗前和放虾苗后
而使用石灰杀青苔一般是在放虾苗前杀青苔，只需将石灰撒在青苔表面即可杀灭青苔，然后放干水，重新灌水肥塘。
而当池中已经放有虾苗时，因为实际操作困难，尽量不要也不推荐使用石灰杀青苔。如果要使用石灰一定要注意浓度适当就不会对虾子有害。一般鱼虾池塘消毒可以使用生石灰，每亩每米水深10-15千克，不会导致鱼虾死亡或产生伤害，还可以净化水质。注意选择晴好、气压高、有微风不闷热的天气。
一、当虾池有虾苗时有少量青苔的处理方法：
①、当虾池已放养虾苗而出现少量青苔时，此时应尽可能的抬高池水水位，繁殖单胞藻，使池水肥起来，让青苔繁殖不起来，抑制生长。
为虾池建立新的生态平衡，清塘后立即培肥水质，不让青苔出现，前期水深50厘米，后期水深可逐渐加到1.2米，透明度30—35厘米。万一出现青苔，要及早采取措施，可局部用药物杀灭，人工捞往往越捞越多。
二、当虾苗池有虾苗而青苔多时的处理方法
①、硫酸铜、清苔净杀青苔效果较好，但硫酸铜毒性随水温变化较大，必须计算准确，一般0.7克/米3对虾是安全的,用药20小时后要适当换水.清苔净用土拌匀后干撒比用水泼效果好。
②、五氯酚钠也能杀灭青苔，3—5克/米3的用药量，既能清塘又能杀灭青苔，而对青虾、螃蟹等甲壳类不起什么作用。
③、尿素对青苔也有杀灭作用，可以直接干撒在青苔上，3—5天后再撒一次。