具体原因有两方面：
一，施肥过多：藕田里面的藕由于需要大量的肥料才能够快速生长，所以一般养殖户都会在藕田里面使用大量的尿素和磷肥，让水体在短时间之内快速肥起来，有机质快速生成，这样莲藕才会大量吸收氨氮磷从而快速生长，这样长出来的莲藕又大又肥又白，我们这里附近的一块大湖泊以前就是专门种植莲藕的，所以对肥水促进莲藕快速生长还是比较熟悉的，因为我经常下去看下去赚。
不过这里有一个问题就是使用尿素和磷肥过多之后，容易导致养殖水体氨氮含量过高，在温度升高以后，很容易引起有机质酸化，这样底质恶化，淤泥过多。小龙虾在水体下层活动的话，很容易挂脏，长出来的小龙虾又黑又脏，腹部挂满淤泥。这是其一。
其二，有机质酸化：在高温条件下，也是最适合纤毛虫生长繁殖的。作为一种生命力顽强的寄生虫，最喜欢高温以及以及淤泥过厚的环境。它又不会直接引起小龙虾死亡，主要是通过小龙虾鳃部唿吸以及摄食饵料进入小龙虾体内，最终寄生在小龙虾身上，在虾壳表面长出一层白毛，加上在淤泥里面活动，所以最终白毛沾附淤泥。导致小龙虾又黑又脏。而且蜕壳困难，行动缓慢，食欲降低，导致营养不良，最终长成了铁壳虾。
那么应该如何改良水体环境呢？
1.芽孢杆菌和光合菌降解有机质：芽孢杆菌和光合菌在溶氧量充足的情况下可以充分降解有机质，减少氨氮浓度，所以适合在无法用生石灰清塘的条件下使用。
